Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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