Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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PTPRJQ12913 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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