Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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STX4Q12846 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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STX4Q12846 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STX4Q12846 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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STX4Q12846 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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STX4Q12846 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STX4Q12846 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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