Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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BPTFQ12830 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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BPTFQ12830 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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BPTFQ12830 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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BPTFQ12830 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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BPTFQ12830 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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BPTFQ12830 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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BPTFQ12830 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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BPTFQ12830 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPTFQ12830 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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BPTFQ12830 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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BPTFQ12830 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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