Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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GTF3C1Q12789 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1Q12789 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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