Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCBP1Q09161 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms