Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN5Q08AF3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN5Q08AF3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms