Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms