Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF4Q08170 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms