Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN11Q06124 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN11Q06124 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms