Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms