Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms