Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms