Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms