Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms