Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FANCCQ00597 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms