Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms