Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFM1P61960 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms