Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2NP61088 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms