Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms