Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSX2P58304 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSX2P58304 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSX2P58304 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VSX2P58304 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VSX2P58304 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSX2P58304 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSX2P58304 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSX2P58304 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSX2P58304 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VSX2P58304 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms