Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXW4P57775 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms