Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIK1P57059 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIK1P57059 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK1P57059 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK1P57059 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK1P57059 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK1P57059 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms