Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRPF1P55201 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms