Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THOP1P52888 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THOP1P52888 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms