Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCT8P50990 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCT8P50990 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCT8P50990 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCT8P50990 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCT8P50990 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCT8P50990 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCT8P50990 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCT8P50990 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCT8P50990 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCT8P50990 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCT8P50990 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCT8P50990 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCT8P50990 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCT8P50990 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCT8P50990 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCT8P50990 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCT8P50990 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCT8P50990 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCT8P50990 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCT8P50990 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms