Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETV1P50549 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms