Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLK1P49759 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLK1P49759 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLK1P49759 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms