Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms