Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms