Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms