Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPN7P35236 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms