Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms