Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJA4P35212 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJA4P35212 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJA4P35212 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms