Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms