Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms