Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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