Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APCP25054 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APCP25054 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APCP25054 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APCP25054 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APCP25054 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APCP25054 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
APCP25054 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
APCP25054 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APCP25054 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APCP25054 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APCP25054 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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APCP25054 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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APCP25054 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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APCP25054 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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APCP25054 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APCP25054 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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