Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2AP24928 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms