Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCHP24723 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms