Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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