Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms