Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL3P19876 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL3P19876 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL3P19876 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL3P19876 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL3P19876 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL3P19876 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL3P19876 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL3P19876 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL3P19876 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL3P19876 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL3P19876 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL3P19876 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL3P19876 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms