Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHCEP18577 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHCEP18577 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHCEP18577 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHCEP18577 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms