Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC087762.1-201ENST00000559755 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB1P14653 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms