Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC130P13994 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms