Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms