Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI2P10070 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI2P10070 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI2P10070 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI2P10070 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI2P10070 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI2P10070 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI2P10070 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI2P10070 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI2P10070 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI2P10070 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI2P10070 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI2P10070 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI2P10070 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI2P10070 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI2P10070 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI2P10070 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI2P10070 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI2P10070 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GLI2P10070 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GLI2P10070 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI2P10070 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms