Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGPD2P0DJD1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms