Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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